在深圳，协议离婚后的房产登记问题需遵循《中华人民共和国民法典》及相关法律法规，夫妻双方应按照离婚协议的约定办理房产过户手续。
分析过程：
准备材料：根据深圳市不动产登记中心的要求，准备相关材料，包括离婚证、离婚协议书(明确房产分割情况)、身份证明、房产证等。
过户申请：前夫妻双方应携带上述材料，前往深圳市不动产登记中心提交过户申请。
缴纳税费：根据规定缴纳相应的契税、印花税等税费。
完成过户：审核通过后，不动产登记中心将办理新的房产证，反映房产所有权的变更。
论述依据：
根据《中华人民共和国民法典》千零七十六条，夫妻双方可以签订书面离婚协议，约定财产分割等事项。
千零八十七条规定，离婚时夫妻共同财产由双方协议处理;协议不成时，由人民法院判决。
建议：在协议离婚后办理深圳房产登记时，建议双方保持沟通和协作，确保按照离婚协议约定的内容办理相关手续。若遇到复杂情况或对方不配合，应及时寻求专业律师的帮助。此外，为了确保流程顺畅，建议提前咨询当地不动产登记中心，了解详细流程和所需材料。在整个过程中，保持冷静和理性，依法维护自己的权益。
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